蓝原柚子（竹达彩奈 配音）是一名高中一年级的女生，外表看上去非常时尚的她，实际上却是一个内心里意外的天真，一点恋爱经验都没有的纯情女孩。由于家庭的原因，柚子进入了一所女子高中就读，这让柚子的心里非常不满，因为在这里，她能交到男朋友的概率简直微乎其微。刚刚入学的第一天，柚子便和学生会长芽衣（津田美波 配音）相遇了。芽衣是学校里公认的美人，无论是外表还是成绩还是家世都将其他的同龄人远远的抛在身后。柚子因为一场误会而对芽衣的影响极为糟糕，更糟糕的是，当她回到家里时发现，芽衣竟然成为了她的义姐，两人即将住进同一屋檐下。
雏见泽是一处坐落在群山环绕之间的僻静村庄，淳朴的民风使得这个古老的村庄一直以来都保留着祖先时代的祭祀习俗，称为绵流。昭和58年的一个夏天，这个村庄迎来了一个新的居民：少年前原圭一（保志总一朗 配音）。新的环境让圭一有些不太能适应，但在结识了温柔的龙宫礼奈（中原麻衣 配音），活泼的园崎魅音（雪野五月 配音），外表孱弱却内心坚强的北条沙都子（金井美香 配音）和古手梨花（田村由里香 配音）后，新的生活很快便如火如荼的展开了。随着时间的推移，一年一度的绵流祭奠即将开始，然而在此热闹之际，圭一却听闻了一些雏见泽不为人知的过去，以及历年来绵流祭奠所带来的，一人失踪一人死亡的被称为“神隐”的恐怖事件。这些传闻是虚是实？过往单纯快乐的生活是真是假？作为一名“外来者”，前原圭一出人意料的逐渐接近了某个重大事件的真相。
这是一个魔女与人类共存的世界，为了保证魔女的身份不被揭穿，被人类发现了真实身份的魔女都会变成魔女青蛙，唯有另一个拥有正式身份的魔女才能够解开魔法。一次偶然中，一直梦想者能够成为魔女的少女春风Doremi（千叶千惠巳 配音）撞破了魔女莉卡的身份，无奈之下，莉卡只得将春风收为见习魔女。春风必须经历漫长而艰苦的修炼，通过魔女的考试才能够正式获得魔女资格。在此之后，成熟稳重，性格文静的藤原羽月（秋谷智子 配音），精明强干活泼好动的妹尾爱子（松冈由贵 配音），傲娇跋扈但内心善良的濑川音符（宍戸留美 配音）春风的妹妹春风泡泡（大谷育江 配音）等人都因发现了春风的身份而接连成为了见习魔女。随着时间的流逝，对于女孩们来说，通过魔女考试反而成为了次要目的，最重要的是，一定要利用各自的魔法能力让人们获得幸福。
