被称为木星蜥蜴的神秘敌人第一次袭击地球是在2195年，面对拥有压倒性力量的敌人，地球军束手无策，火星连同殖民地一起落入敌人手中。这就是“第一次火星会战”一年之后，为了夺回火星，民间组织尼鲁加路重工以最新的科技造出新型战舰NADESICO号，召集来的船员包括以年轻的女舰长御统由利加为首，她青梅竹马的朋友，身兼厨师和机师的天河名人，其他船员虽然各有所长，但人格和来历都有一点问题。在战斗变得白热化之际，一个重大的真相被揭发了，敌人原来是100年前被放逐到木星的地球人子孙。他们想得到能够令其运用来往行星间的瞬间移动技术，玻色子跳跃的火星遗迹。跟木连的和谈以失败告终，为了争夺火星的遗迹，NADESICO、木连和尼鲁加路的三方混战开始了，到此为止，是地球跟木连战斗的历史，后来，地球和木连结盟，宇宙总算恢复和平，以上是TV版的剧情。
五角世界是一个由五颗行星围绕双太阳（太阳）组成的太阳系。在科姆星球的郊外，住着两个年轻人，达巴麦洛德和米拉乌曹，他们怀揣着远大的志向，离开家乡。五角世界虽然由统治者波塞冬统治，但政治腐败，各地叛军兴起，战乱不断。当达巴和他的朋友们遇到前强盗法内里亚·阿姆 (Fanneria Am) 和同样雄心勃勃的加布里特·加布雷 (Gabret Gabrai) 并发生冲突时，他们了解了五角大楼世界的真正本质。达巴驾驶着重金属L-Gaim与波塞冬军作战，最终成为叛军的领袖。
紫大悟原作、クレタ插画小说《魔王2099》宣布改编为电视动画
