2010年，香港警队刑事情报高级督察卓凯（苗侨伟 饰）前往泰国曼谷，与当地潜伏的卧底追查跨国贩毒线。谁知过程中吉运帮头目Pak Key及其手下乐少锋（周柏豪 饰）突然介入，打乱计划。卓凯一行撤退时更遭遇一场精心策划的大爆炸，导致其他卧底命丧火海。返港之后，卓凯心灰意冷，有意辞职。就在此时，香港最大的社团长兴祸起萧墙，昔日同袍持刀相向，大战一触即发。另一方面，高级督察黎瑞权（张兆辉 饰）唯恐长兴内部的5个卧底身份曝光，情急之下删掉卧底档案。
柏飞（陈山聪饰）、姜曦文（刘佩玥饰）、刘力（林子善饰）投身警队后师从罗友邦，四师徒感情深厚。三年前的追捕行动，友邦殉职、刘力重伤，曦文归咎于柏飞急功近利引致悲剧，友情破裂。一宗连环谋杀案再将柏飞、曦文联系起來，卧底温嘉莉（刘颖镟饰）奉命混入犯罪集团，却重遇前男友招俊朗（张振朗饰），关系纠缠不清。柏飞、曦文接二连三收到神秘讯息提示，上级遂将两组探员合并成神秘讯息情报科，侦查多宗扑朔迷离的命案。由手机助理发出的提示为何每每能引领团队超前破案，「她」是敌是友？
