本作以校风严格的名门进学男子高中“开明学院”为舞台，学校规定学生只能学习，禁止一切恋爱和娱乐。纲启永饰演担任了学生会长及猜谜研究会会长的精英男高中生凤启介，他是学生的模范和领袖，把人生的一切都献给了学习，然而他偶然遇到的一位美少女却让他萌生的恋爱之心，令他开启了单相思。本田响矢，一之濑亘，若林时英，突然出现哥饰演凤在猜谜研究会的伙伴们，他们担心恋爱脑上身的凤，拼命阻止凤的恋爱。
第三季也发生了各种各样的奇怪事件。科学犯罪对策团队能否用最先进的科学解开并解决这些“禁忌事件”？
在学校举办的“王子”选拔赛中，优雅自信的富家子弟朱雀奏和混迹街头的坏小子京极是主要的争夺者，但竞争者可不止他们二人。
受医疗制度改革的影响，曾经显赫一时的大学医院——帝都医科大学第三医院因医疗状况恶化和工作压力过大导致卓越出众的医师纷纷离职，人才流失造成医院的发展岌岌可危。在此背景之下，不属于大学医院和医局体制的自由医生应运而生。美丽性感的外科医生大门未知子（米仓凉子 饰）便是自由医生的一员，她被人称作“Doctor X”，讨厌拉帮结派和医疗腐败，有如一朵盛开在泥沼中的带刺野玫瑰。未知子的到来给了这间迂腐凝滞的一前所未有的冲击，而她过硬的外科技术和理论知识又令同侪钦佩与嫉妒。战战兢兢的新人森本光（田中圭 饰）负责带领这名曾涉足海外的传奇人物。未知子将迎战各种疑难杂症以及无形的阻碍……
本剧讲述了五十岚赖人向恋人筒井凛然正式求婚前，就在这时，一直以来都坚定地尽量避免失败的他面前，突然出现了一位神秘的大叔，向五十岚泼了红酒，并说：“如果不中止求婚的话，你的人生将会非常失败。”大叔还自称为30年后的五十岚，并预告之后会有来电。和预告一样，打来电话是大学时代的同期生· 清水…
由宫藤官九郎写的每集10分钟的剧本，同一个场景由不同的人演绎将会呈现出怎么样的效果呢。
在旅行的列车上，美雪（铃木杏 饰）再次邂逅了金田一（松本润 饰），并追随于他。同伴用手中的DV记录着发生的一切。某夜，一个木偶团长不幸被害。案发后，警探发现他原本在车厢里的尸体不翼而飞，于是引起了一阵骚乱。探长决定在一家酒店暂时住下，找寻犯罪嫌疑人，金田一等人也一同前往。后来，根据案情，嫌疑人被锁定在木偶团体成员之中，探长想通过体重以缩小搜查范围。但是，一个女成员的意外死亡，却让金田一发现了隐藏的秘密，并由此揭开了一桩尘封多年的旧案真相…… 本片根据天树征丸的漫画改编，除上述特别版魔术列车杀人事件外，还包括以下6个事件，分别为幽灵客船杀人事件、法兰西银币杀人事件、黑死蝶杀人事件、速水玲香诱拐杀人事件、魔术的森杀人事件和露西亚人形杀人事件。
