“我毕业于东中，叫做凉宫春日。我对普通的人类没有兴趣。你们之中要是有外星人、未来人、异世界人或者超能力者的话，就尽管来找我吧。”这是凉宫春日的宣言，也是她对于平庸生活的挑战。我们可能在很小时就不再相信圣诞老人的存在，也慢慢不会再对外星人，特异功能等等产生幻想。在生活的教化下习惯于平淡无奇的生活。可是不安于现状的凉宫同学却勇敢的建立起SOS团，用强烈的意志去试图改造这个了无新意的世界。她的忧郁，究竟从何而来，又将从何而去。
“这种想要为别人加油的感情……是从何而来的呢？” 鹰之咲高中，是一个准备卫冕啦啦操全国大赛的名门学校。而啦啦操社的美空彼方，在初中时就拿过全国冠军，高一时就成为了正选队员，但却因为在大赛中的失误，再也跳不起来了。 而在某天，彼方看到了高速在大楼之间飞跃的跑酷高中女生，小父内凉叶。 除了她们两人，还有艺术体操大小姐诗音；从巴西归来的混血儿杏那；杏那的同班同学，瑜伽哲学女生稳花；以及彼方的前队友，坐在轮椅上的女生惠深。 兴趣、特长乃至性格都各自不同的成员们时而一起歌唱，时而发生冲突，时而表演短剧，时而想入非非…… 而当想为人加油的纯粹想法产生共鸣时，“花球嘭嘭”的加油便会超越啦啦操的范畴，直接传达到人心中。 群马的六个女高中生的加油， 也许能让世界有所改变？
内详
「思い出して、翅（はね）があったころのことを」 1万2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。 太陽と月と火星が出会うとき、新たな合体の調べが流れる──！ 湘南の海に浮かぶ小島、江の島。 美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島学園〉はある。 学園には、全国から優秀な子どもが集められ、 最新の機器を使った英才教育が施されていた。 特殊強化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、 感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、 謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる。 戦いのさなか、不可思議なヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──。 「想星合体！ GO、アクエリオン！」 繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン。 宿命を背負った少年少女は、 得体のしれない団体〈宇宙たまごの会〉や大人たちの思惑が交錯す...
