《茶啊二中第六季》时间线来到初三，欢乐的校园日常仍在继续，孩子们迎来了老师、家长们更多的“关爱”，也面临着新的成长挑战，这一季中，大家在校园和家庭生活过程中发生的点滴小事里，凝聚了师生情、友情、亲情的力量，展示了一群平凡却又特别的初中生有笑有泪、真挚动人的青春成长故事。
继萌宝战警第二季之后，宇宙邪恶势力世星大帝以及余党铁算盘、塔库玛司令之类再次受到挫败，萌宝战警拯救了地球上的恐龙等古生物，这些活化石见证了整个地球的繁衍盛衰，同时也回归到了适合的生存环境，它们将于人类和谐共处。
种兵沈辣天生阴阳眼，在云南边境抓捕毒枭任务中，偶入古滇国山洞，遭遇远古祭祀干尸复活，沈辣小分队几乎全军覆没。在这危急时刻，神秘白发男子吴勉将沈辣和缉毒警察孙德胜一并救出。干尸事件后，二人机缘巧合进入“民俗事务调查研究局”，在一次次超自然事件中逐渐成长，揭开另一个世界的面纱。这是一个无处不在却不为人知的世界这个世界里，有一个神通广大隐匿在世人视野之外的神秘部门 有一群身怀秘术活得风生水起的凡人 还有那些超脱了轮回却依旧混迹凡尘的传奇 于芸芸众生而言，他们是看不见摸不着却又实实在在的坚强护盾 于邪魔外道而言，他们是令人欲除之而后快的眼中钉肉中刺 而对他们自己而言，他们只是有血有肉的人 有爱有恨，有喜有悲，身在大千世界，心怀大千世界 微不足道，却又重要无比。
