拜别仙山后，莫衣与百里东君两大绝世高手退隐。萧瑟隐脉已然恢复，重回逍遥天境，雷无桀等人也相继得到仙人馈赠，实力也有不同地提升。众人决心赶赴天启城，江湖一别，朝堂再见。永安王萧瑟、白王萧崇、赤王萧羽三大势力汇聚一堂，夺嫡之争正式上演，谁又将登上那天启乘龙之位.......
继萌宝战警第二季之后，宇宙邪恶势力世星大帝以及余党铁算盘、塔库玛司令之类再次受到挫败，萌宝战警拯救了地球上的恐龙等古生物，这些活化石见证了整个地球的繁衍盛衰，同时也回归到了适合的生存环境，它们将于人类和谐共处。
大辰国帝后因意外互换了身份，原本两看生厌的人却因为互换体会到了彼此的难处。在互换的过程中，逐渐开始互相理解、互相信任。在边疆告急的危机关头，萧锦昀（实际为徐钰）为平定边境御驾亲征，最终凯旋而归。就在帝后二人克服万难顺利换回身体之后，鞑靼女王却突然入宫。与此同时，朝野之中，三王爷想要夺权的心思昭然若揭......
