动画版《世界毁灭》是由制作过《攻壳机动队》系列的ProductionI.G担当制作。动画版与游戏的基本设定都相同，比如受困于毁灭世界委员会和砂之海之间的这个世界等等。但是女主角莫尔特携带了毁灭世界的秘宝，以及克里埃和莉?嗄分属两个对立组织的成员等，这其中有一部分设定是动画版新追加的。与游戏及漫画展开不同的情节这也正是动画版的魅力所在。动画上映同时，漫画也将于7月开始连载。
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……
