继萌宝战警第二季之后，宇宙邪恶势力世星大帝以及余党铁算盘、塔库玛司令之类再次受到挫败，萌宝战警拯救了地球上的恐龙等古生物，这些活化石见证了整个地球的繁衍盛衰，同时也回归到了适合的生存环境，它们将于人类和谐共处。
九霄大陆一代灵宗百里云霄，死后重生都市年少之时，改写人生，重登世界之巅，重返学堂，拾起年少轻狂，一手绝世医术，一身至尊功法，一生挚爱相随，勇斗富少，揭露黑医，国难当头冲阵在前，以重生之躯，再闯九天云外，报血海深仇。
