继萌宝战警第二季之后，宇宙邪恶势力世星大帝以及余党铁算盘、塔库玛司令之类再次受到挫败，萌宝战警拯救了地球上的恐龙等古生物，这些活化石见证了整个地球的繁衍盛衰，同时也回归到了适合的生存环境，它们将于人类和谐共处。
【迦南学院篇】三年之约后，萧炎终于在迦南学院见到了薰儿，此后他广交挚友并成立磐门；为继续提升实力以三上云岚宗为父复仇，他以身犯险深入天焚炼气塔吞噬陨落心炎……【决战云岚篇】萧炎横扫云岚宗成功复仇，谁知药老的灵魂却被魂殿掳走。为抓萧炎，魂殿暗借小医仙之手，命毒宗围剿萧炎的炎盟。刚晋级斗皇的萧炎虽成功化解危机，却也身中魔毒斑。为解此毒，更是为了解救药老，萧炎带着小医仙和紫研前往中州，殊不知，等待他们命运的竟然是……
