200年前，超元世界的人类和来自其他世界的怪兽发生了战争。为了对抗强大的怪兽，人类发明了超元卡装置，将怪兽封印在超元卡中，结束了战争。主人公云天曾是一位热爱超元卡比赛的少年，但是体质特殊的他无法控制好超元卡中的怪兽能量。一天，他意外从爸爸发掘的古遗迹中获得了一个神奇的卡盒。云天决定前往寻找4张传说超元卡，希望用向超元卡许愿的方式找回哥哥。就这样，云天告别了父母，踏上旅程
平平无奇的少年陈平被父亲送入满是天才的超能学院，却成为了最弱职业卡牌师，直到某日陈平进入从小就多次梦见的原界，得到神秘人的指点，发现卡牌师并非最弱辅助职业，从此他的人生得到巨大改变。
